تحميل ملفات البروتينات

برنامج راستوب Rastop هو أحد البرامج المستعملة في عرض ودراسة البنية الفراغية للجزيئات الحيوية وخاصة منها البروتينات. تم تطويره من برنامج Rasmol أو Raswin الذي ينتشر استعماله في مختلف أنحاء العالم خاصة في المستويات الجامعية. وقع الاختيار على هذا البرنامج لمجانيته وسهولة استعماله نسبيا خاصة بالنسبة للمستوى الثانوي.
يمكن للمتعلم الذي يرغب في تطوير مهاراته في هذا الميدان استعمال برامج أخرى أكثر تطورا لكنها قد تتناسب أكثر مع المستويات الجامعية المتقدمة.

الخطوة الثانية



توجد الملفات الأصلية للبروتينات في بنك خاص يسمى بنك البروتينات
( Prot�ine Data Bank ( PDB،
وكل بروتين له رمز واحد خاص به فمعرفته تسهل الحصول على ملفات
البروتينات ، ونظرا لكثرة عدد البروتينات التي توجد في بنك PDB
( أكثر من
43633
) قمنا بوضع بعض ملفات البروتينات في هذا الموقع
لتسهيل تحميلها من طرف المتعلم
، بالنقر على اسم البروتينات المدونة في
الجدول
الموالي تظهر لك نافذة
T�l�chargement
de Fichierانقر
علىEnregistrer
ليتم حفظ الملف في المجلد الذي اخترته ،
في هذه الحالة يتم تحميله بشكل مضغوط يتطلب
فتحه توفر برنامجWin RAR أو Win
Zip
ليتم استخلاصه بشكل ملف عادي .


ملاحظة
: يستحسن وضع ملفات البروتينات التي تم
حملها في نفس المجلد الذي تم فيه وضع برنامج راستوب
.

أما إذا أردت
الحصول على ملفات أخرى من البروتينات اتصل بالموقع الأصلي


http://www.rcsb.org/pdb
، الذي يحتوي على ملفات لمعلومات عن بنية ثلاثية الإبعاد للجزيئات الكبيرة (
الحموض النووية،البروتينات....)،

للحصول على ملف البروتين اتبع الخطوات التالية:

بعد الدخول إلى الموقع تظهر لك نافذة قم بإدخال رمز البروتين في مستطيل
البحث.

انقر على الأمر
Search تظهر نافذة تحتوي على
ملفات خاصة للبروتين.

اختر ملف البروتين الذي تريد دراسته حسب الركيزة و المصدر .

انقر على الأمر

Download
ثم اختر شكل الملف على صورة

PDB
.

تظهر نافذة صغيرة لتحميل ملف البروتين اختر المجلد الذي تريد أن تحفظه فيه
ثم انقر على

OK
.

ماذا يعني ملف PDB ؟