تحميل ملفات البروتينات

توجد الملفات الأصلية للبروتينات في بنك خاص يسمى بنك البروتينات ( Prot�ine Data Bank ( PDB، وكل بروتين له رمز واحد خاص به فمعرفته تسهل الحصول على ملفات البروتينات ، ونظرا لكثرة عدد البروتينات التي توجد في بنك PDB ( أكثر من 43633 ) قمنا بوضع بعض ملفات البروتينات في هذا الموقع لتسهيل تحميلها من طرف المتعلم ، بالنقر على اسم البروتينات المدونة في الجدول الموالي تظهر لك نافذة T�l�chargement de Fichierانقر علىEnregistrer ليتم حفظ الملف في المجلد الذي اخترته ، في هذه الحالة يتم تحميله بشكل مضغوط يتطلب فتحه توفر برنامج Win RAR أو Win Zip ليتم استخلاصه بشكل ملف عادي .

ملاحظة : يستحسن وضع ملفات البروتينات التي تم حملها في نفس المجلد الذي تم فيه وضع برنامج راستوب .



تصنيفه

رمزه الموافق

اسم البروتين

إنزيم مرتبط بالركيزة

1HEW

Lysozyme

إنزيم الليزوزيم مرتبط بـNAG6

1LZS

Lysozyme

إنزيم كربوكسيبتيداز

3CPA

Carboxyptidase

هرمون الأنسولين (الإنسان)

2hiu

Insuline

بروتين دموي

1A6G

Myoglobine



بروتين دموي



2DN1

Oxyh�moglobine

2DN3

carbomnonoxyh�moglobine

2DN2

D�oxyh�moglobine

بروتين مناعي

IGGTOTAL

Immunoglobulin

IGG - LYS
Fab fragment -entibody

البروتينات الناقلة

1SUK

Facilitative glucose transporter

1WPE

Pompe de Calcium



الأنظمة الضوئية



1JBO

Photosystem I(PSI)

2AXT

Photosystem II(PSII)

ATP Synthas

1C17

ATP Synthas F0

1E79

ATP Synthas F1

قناة البوتاسيوم

1BL8

Potassium channel protein

مستقبل الاسيتيل كولين

2BG9

The Nicotinic acetylcholine receptor



أما إذا أردت الحصول على ملفات أخرى من البروتينات اتصل بالموقع الأصلي http://www.rcsb.org/pdb ، الذي يحتوي على ملفات لمعلومات عن بنية ثلاثية الإبعاد للجزيئات الكبيرة ( الحموض النووية،البروتينات....)، للحصول على ملف البروتين اتبع الخطوات التالية:

بعد الدخول إلى الموقع تظهر لك نافذة قم بإدخال رمز البروتين في مستطيل البحث.

انقر على الأمر Search تظهر نافذة تحتوي على ملفات خاصة للبروتين.

اختر ملف البروتين الذي تريد دراسته حسب الركيزة و المصدر .

انقر على الأمر Download ثم اختر شكل الملف على صورة PDB .

تظهر نافذة صغيرة لتحميل ملف البروتين اختر المجلد الذي تريد أن تحفظه فيه ثم انقر على OK .

ماذا يعني ملف PDB ؟

هو ملف نصي يصف وضعية الذرات المكونة للجزيئة في أبعادها الثلاثة منها : البروتينات ، الأحماض النووية و الجزيئات البسيطة كالأحماض الأمينية و الماء..