الرئيسية
الخطوة الثانية
برنامج راستوب
Rastop
هو أحد البرامج المستعملة في عرض ودراسة البنية الفراغية للجزيئات الحيوية وخاصة منها
البروتينات. تم تطويره من برنامج
Rasmol
أو Raswin
الذي ينتشر استعماله في مختلف أنحاء العالم خاصة في المستويات الجامعية.
وقع الاختيار على هذا البرنامج لمجانيته وسهولة استعماله
نسبيا خاصة بالنسبة للمستوى الثانوي.
يمكن للمتعلم
الذي يرغب في تطوير مهاراته في هذا الميدان استعمال برامج أخرى أكثر تطورا لكنها
قد تتناسب
أكثر مع المستويات الجامعية المتقدمة.
توجد الملفات الأصلية للبروتينات في بنك خاص يسمى بنك البروتينات
( Prot�ine Data Bank ( PDB،
وكل بروتين له رمز واحد خاص به فمعرفته تسهل الحصول على ملفات
البروتينات ، ونظرا لكثرة عدد البروتينات التي توجد في بنك PDB
( أكثر من
43633
) قمنا بوضع بعض ملفات البروتينات في هذا الموقع
لتسهيل تحميلها من طرف المتعلم
، بالنقر على اسم البروتينات المدونة في
الجدول
الموالي تظهر لك نافذة
T�l�chargement
de Fichierانقر
علىEnregistrer
ليتم حفظ الملف في المجلد الذي اخترته ،
في هذه الحالة يتم تحميله بشكل مضغوط يتطلب
فتحه توفر برنامجWin RAR أو Win
Zip
ليتم استخلاصه بشكل ملف عادي .
ملاحظة
: يستحسن وضع ملفات البروتينات التي تم
حملها في نفس المجلد الذي تم فيه وضع برنامج راستوب
.
| تصنيفه | رمزه الموافق | اسم البروتين |
| إنزيم مرتبط بالركيزة | 1HEW | Lysozyme |
| إنزيم الليزوزيم مرتبط بـNAG6 | 1LZS | Lysozyme |
| إنزيم كربوكسيبتيداز | 3CPA | Carboxyptidase |
| هرمون الأنسولين (الإنسان) | 2hiu | Insuline |
| بروتين دموي | 1A6G | Myoglobine |
| بروتين دموي | 2DN1 | Oxyh�moglobine |
| 2DN3 | carbomnonoxyh�moglobine | |
| 2DN2 | D�oxyh�moglobine | |
| بروتين مناعي | IGGTOTAL | Immunoglobulin |
| IGG - LYS | Fab fragment -entibody | |
| البروتينات الناقلة | 1SUK | Facilitative glucose transporter |
| 1WPE | Pompe de Calcium | |
| الأنظمة الضوئية | 1JBO | Photosystem I(PSI) |
| 2AXT | Photosystem II(PSII) | |
| ATP Synthas | 1C17 | ATP Synthas F0 |
| 1E79 | ATP Synthas F1 | |
| قناة البوتاسيوم | 1BL8 | Potassium channel protein |
| مستقبل الاسيتيل كولين | 2BG9 | The Nicotinic acetylcholine receptor |
أما إذا أردت
الحصول على ملفات أخرى من البروتينات اتصل بالموقع الأصلي
http://www.rcsb.org/pdb
، الذي يحتوي على ملفات لمعلومات عن بنية ثلاثية الإبعاد للجزيئات الكبيرة (
الحموض النووية،البروتينات....)،
للحصول على ملف البروتين اتبع الخطوات التالية:
بعد الدخول إلى الموقع تظهر لك نافذة قم بإدخال رمز البروتين في مستطيل
البحث.
انقر على الأمر
Search تظهر نافذة تحتوي على
ملفات خاصة للبروتين.
اختر ملف البروتين الذي تريد دراسته حسب الركيزة و المصدر .
انقر على الأمر
Download
ثم اختر شكل الملف على صورة
PDB
.
تظهر نافذة صغيرة لتحميل ملف البروتين اختر المجلد الذي تريد أن تحفظه فيه
ثم انقر على
OK
.
ماذا يعني ملف PDB ؟
هو
ملف نصي يصف وضعية الذرات المكونة للجزيئة في أبعادها الثلاثة منها :
البروتينات ، الأحماض النووية و الجزيئات البسيطة كالأحماض الأمينية و الماء...
منقول من :
http://www.ens-kouba.dz
» إختبار الثلاثي الثالث مادة العلوم الطبيعية
» دلیل بناء اختبار مادة علوم الطبیعة والحیاة في امتحان شھادة البكالوریا – أكتوبر 2017
» ملفات مفتوحة المصدر لجميع مصممين الدعاية والاعلان
» مادة الرياضيات السنة الاولى ثانوي
» برنامج لصنع توقيت مؤسسة تربوية
» كل ما يخص الثانية متوسط من مذكرات ووثائق للأساتذة
» المنهاج والوثيقة المرافقة له للجيل الثاني في كل المواد لمرحلة التعليم المتوسط
» دليل استخدام كتاب الرياضيات الجيل الثاني سنة4